Toppen av den katolska kyrkan, inklusive påven Pius XII själv, var mycket passiva i att fördöma och kritisera de nazistiska och fascistiska regimerna i Europa före och under andra världskriget. De hjälpte också fascistiska och nazistiska politiker och militära ledare att fly Europa efter kriget. Kroatiska präster deltog i Ustasha-regimen och offentligt identifierade som Ustashas. Många katolska präster undvek dock att samarbeta med Ustasha, och några samarbetade till och med med den antifascistiska rörelsen.
Decennier efter andra världskriget har påven Franciskus och toppen av den katolska kyrkan högljutt fördömt varje uppmjukning av fascistiska och nazistiska övertygelser. De har uttryckt oro för samtida politiker som hetsar till hat mot marginaliserade grupper och har betonat att de är oförenliga med den katolska kyrkans värderingar. Den katolska kyrkan i Kroatien har dock inte fördömt sång av Ustasha-sånger, innehav av Ustasha-symboler och glorifiering av Ustasha-tro. De har hållit bokkampanjer och varit värd för diskussioner som omtolkar Ustasha-regimens historia. Det har inte förekommit något offentligt fördömande av präster som samarbetat med fascisterna eller uppskattning för dem som anslöt sig till det antifascistiska motståndet. Den katolska kyrkan i Kroatien anklagas för att vara mer bekymrad över politiska än moraliska eller teologiska aspekter och kallas fortfarande för ”Stepinac-kyrkan”.
